Lembaga Wakaf Masjid adalah unit organisasi di bawah naungan yayasan masjid yang fokus mengelola dan mengembangkan harta wakaf secara produktif untuk keberlanjutan operasional masjid. Lembaga ini harus memenuhi standar Badan Wakaf Indonesia (BWI) dan memiliki tata kelola yang transparan. Berbeda dengan takmir harian, lembaga wakaf lebih berorientasi pada investasi jangka panjang, seperti pembangunan properti di atas tanah wakaf atau pengelolaan portofolio keuangan syariah yang hasilnya digunakan untuk membiayai kegiatan rutin masjid tanpa memberatkan kotak amal jamaah.
Bagi pelaku usaha yang ingin berwakaf produktif, lembaga ini merupakan mitra strategis untuk memastikan dana abadi mereka berkembang. Praktisi keuangan di lembaga wakaf masjid dituntut memiliki keahlian analisis investasi selain pemahaman fiqih wakaf. Konsultan manajemen menyarankan pemisahan manajemen lembaga wakaf dari kepengurusan takmir masjid harian guna menghindari konflik kepentingan dan menjamin profesionalisme bisnis. Penggunaan software sistem keuangan wakaf sangat membantu dalam menyajikan laporan pertumbuhan nilai aset wakaf kepada para wakif (pemberi wakaf) secara transparan dan akuntabel setiap periode fiskal.
